MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2540

Total Repeats: 8268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018586	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018586	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018586	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018586	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018586	G	6	6	307	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018586	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018586	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018586	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018586	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018586	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018586	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018586	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018586	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018586	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_018586	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018586	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018586	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018586	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018586	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018586	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018586	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018586	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018586	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018586	T	6	6	10643	10648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018586	AGT	2	6	13929	13934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018586	AAC	2	6	13967	13972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018586	AAT	2	6	14016	14021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018586	GAA	2	6	14070	14075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018586	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018586	GCTT	2	8	14135	14142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018586	GCT	2	6	14187	14192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018586	AT	3	6	14213	14218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018586	CAA	2	6	14336	14341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018586	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018586	CTG	3	9	14461	14469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018586	GAA	2	6	14481	14486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018586	TCA	2	6	14515	14520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018586	ATGC	2	8	14556	14563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018586	AAT	2	6	14618	14623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018586	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018586	AGC	2	6	15880	15885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018586	TGC	2	6	15904	15909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018586	T	6	6	15910	15915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018586	AT	3	6	15974	15979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018586	A	6	6	16063	16068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018586	T	7	7	16078	16084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018586	T	6	6	16108	16113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018586	CTT	2	6	16138	16143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018586	G	6	6	17328	17333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018586	CTC	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018586	T	8	8	21500	21507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018586	A	6	6	21562	21567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018586	ATT	2	6	21574	21579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018586	GA	3	6	21632	21637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018586	TCA	2	6	23106	23111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018586	AAATG	2	10	24024	24033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018586	TTA	2	6	24073	24078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018586	A	6	6	24121	24126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018586	CG	3	6	24165	24170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018586	AAG	2	6	25845	25850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018586	GGA	2	6	27480	27485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018586	ATT	2	6	28223	28228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018586	T	6	6	28236	28241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018586	GGA	2	6	28242	28247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018586	AAAT	2	8	28904	28911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018586	A	7	7	28920	28926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018586	AT	3	6	28951	28956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018586	TCA	2	6	28962	28967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018586	A	6	6	29068	29073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018586	AGGA	2	8	29082	29089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018586	GTC	2	6	29091	29096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018586	TAA	2	6	31012	31017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018586	T	10	10	33322	33331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018586	TCC	2	6	33359	33364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018586	AAAGG	2	10	35585	35594	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018586	TTCTA	2	10	36079	36088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018586	T	6	6	36143	36148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018586	T	6	6	36243	36248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018586	A	6	6	36281	36286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018586	A	7	7	36641	36647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018586	T	7	7	36666	36672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018586	CCTT	2	8	37489	37496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018586	ATA	2	6	38650	38655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018586	CAA	2	6	38709	38714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018586	AGG	2	6	44611	44616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018586	TCT	2	6	44627	44632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018586	A	7	7	44697	44703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018586	ATG	2	6	44737	44742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018586	AAAT	2	8	44790	44797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018586	AGG	2	6	45852	45857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018586	AGA	2	6	45858	45863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018586	C	6	6	45883	45888	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_018586	AGG	2	6	49418	49423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018586	ATAA	2	8	51352	51359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018586	GACTT	2	10	51381	51390	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018586	A	6	6	51415	51420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018586	AGTG	2	8	51429	51436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018586	T	7	7	52110	52116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018586	TC	3	6	52130	52135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018586	TTAG	2	8	52162	52169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018586	TGA	2	6	52177	52182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018586	GTTA	2	8	53527	53534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018586	ATA	2	6	53545	53550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018586	ATT	2	6	53572	53577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018586	GCTC	2	8	53582	53589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018586	ATGGT	2	10	53632	53641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018586	AGG	2	6	53674	53679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018586	ATTC	2	8	53986	53993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018586	GAG	2	6	54022	54027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018586	AGG	2	6	54605	54610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018586	T	6	6	54895	54900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018586	AAG	2	6	54938	54943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018586	TATT	2	8	54955	54962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018586	TA	3	6	54974	54979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018586	A	7	7	54985	54991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018586	T	6	6	55665	55670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018586	ACTT	2	8	55680	55687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018586	AAATA	2	10	55688	55697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018586	A	6	6	55764	55769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018586	T	6	6	55785	55790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018586	TTA	2	6	55833	55838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018586	TAAAA	2	10	56670	56679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018586	GGA	2	6	56723	56728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018586	T	7	7	58811	58817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018586	TGA	2	6	58839	58844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018586	ATA	2	6	58865	58870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018586	TGA	2	6	58872	58877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018586	GTTA	2	8	58881	58888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018586	TTATG	2	10	58892	58901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018586	A	7	7	58935	58941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018586	AATA	2	8	64312	64319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018586	ATA	2	6	64589	64594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018586	CAA	2	6	64908	64913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018586	CATA	2	8	64923	64930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018586	T	6	6	64967	64972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018586	TA	3	6	65019	65024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018586	A	6	6	65024	65029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018586	A	7	7	69034	69040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018586	AAG	2	6	78650	78655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018586	CTT	2	6	78712	78717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018586	TAA	2	6	78866	78871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018586	T	6	6	78904	78909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018586	CTT	2	6	78953	78958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018586	AATAG	2	10	78960	78969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018586	TTA	2	6	78979	78984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018586	T	6	6	78989	78994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018586	CATA	2	8	78996	79003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018586	TAA	2	6	79020	79025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018586	TCTA	2	8	79055	79062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018586	ATAGC	2	10	80118	80127	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_018586	CAA	2	6	80139	80144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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